Важный аспект деятельности современной лаборатории — комплекс микробиологических исследований воды, воздуха и др. С их помощью возможно определение наличия в изучаемой среде патогенных микроорганизмов, вирусов, паразитов.
Человек каждый день обменивается с окружающей средой тысячами микроорганизмов, некоторые из которых могут быть возбудителями инфекций. Контроль состояния окружающей среды, с помощью проведения микробиологических исследований, обеспечивает безопасные условия работы и жизнедеятельности, исключая возможность инфицирования.